在捕鱼儿海（今贝尔湖）聚歼北元主力7万余人，一战打断北元脊梁骨。

此后阿里不哥后裔也速迭儿在瓦剌首领乌格齐哈什哈的帮助下发动政变，诛杀北元皇帝脱古思帖木儿。

自立为卓里克图汗，北元从此分裂为瓦剌、鞑靼、兀良哈三部。

他们彼此攻伐，互相混战。

洪武二十四年（1391年），也速迭儿病逝。

其子恩克即位，恩克在位三年又去世，瓦剌蒙古与东蒙古正统派，拥立脱古思帖木儿次子额勒伯克为大汗。

号尼古哷苏克齐汗，北元汗位再次回归到忽必烈一系。

然而此时的北元大汗已经是名存实亡的傀儡，大权皆出自底下权臣之手。

1402年，朱棣称帝，是为明成祖。

朱棣在位22年，连续发动5次对草原的大规模军事打击运动，是为五征漠北。

北元在明军的持续打击下，伤亡惨重，这才有了后来的仁宣之治的辉煌。

正统四年（1439年），北元太师脱欢逝世。

其子也先继任太师，成为北元朝廷实际上的统治者。

也先雄才大略，在他的努力下，草原上重归一统。

在正统十四年（1449年），也先率军在土木堡歼灭明军20万精锐，一战终结大明帝国昂扬向上的国运。

景泰五年（1454年），也先在政变中被平章阿剌知院刺杀。

随后喀喇沁部孛来又杀了阿剌知院，从此北元再次分裂混战，好不容易稳定的局面再次崩坏。

成化十五年（1479年），济农巴彦蒙克之子巴图孟克继位北元大汗，他就是北元历史上赫赫有名的中兴之主“达延汗”。

成化二十二年（1486年），达延汗诛灭权臣太师亦思马因，自掌朝政。

从洪武二十四年（1391年），也速迭儿病逝到成化二十二年（1486年），达延汗亲政。

整整95年，北元终于有了一个有实权的大汗。

达延汗鉴于权臣频频干预国政的弊端，废除了太师、丞相等官职。

恢复了成吉思汗时代的济农制度，强化了中央集权。