游戏进行到后期，也全员进化成究极体。

阿特拉独角仙兽（蓝）进化为小丑皇

小丑皇Piedmonピエモン

究极体

魔人型

病毒种

名字来源：法语【Pierrot】小丑、德语【Pied Piper of Hamelin】花衣魔笛手

技能：王牌飞剑

奇特的模样、神出鬼没，一切都被谜团包围的魔人型数码兽。魔人型数码兽谜点颇多，与恶魔系、不死系相比，完全是异次元的存在，真面目完全不清楚。到底是为什么出现的，存在目的也不清楚，现阶段还没有手段能够解开这些谜团。但是，其力量强大无比，如果遇到小丑兽就只能诅咒自己的命运。必杀技是心灵传输（Teleport）插在背后「魔术箱（Magic Box）」的四把剑，在下一瞬间穿刺敌人的无法逃脱的技能「王牌飞剑」。

敏捷型

蛇颈龙兽Plesiomonプレシオモン

究极体

长颈龙型

数据种

名字来源：希腊语【Plesiosaur】蛇颈龙

技能：悲伤蓝调

英国未确认生物研究所的计算机内被发现的虚构存在的数码兽。是一个已经在研究者之间成为传闻的数码兽。鲜有现身，被迷雾包围能见度很低的情况下似乎会出现。被洗练到闪耀着白色光辉，神秘的蛇颈龙兽的身姿给人留下深刻的印象。「悲伤蓝调」是发出尖锐、清脆的鸣叫，让听者沉浸在悲伤中而失去战斗意识。

辅助型

三角龙兽进化成狮鹫兽

狮鹫兽Griffomonグリフォモン

究极体

幻兽型