不过这也确实有些意外，明军攻占鸡笼，西班牙人投降消息传来，大员的荷兰人立即动员起来，而此时恰好荷兰和英国人组成的联合舰队正在附近，他们正执行封锁中国海的任务，得到明军大举出动，即将进攻大员，他们立即赶到大员，与大员的荷兰人组成了一支强大的舰队，跨海而来。

荷兰人把这支舰队分成了三个分舰队，伊丽莎白舰队，由英国的乔治爵士指挥，五艘英国四桅74炮战舰和十艘二十炮双桅快帆船加上十艘十炮单桅快船组成。

巴达维亚舰队，由范布隆爵士指挥，一艘一百零四炮的三层炮甲板四桅风帆战列舰旗舰，五艘七十四炮战舰，和十艘二十炮双桅快帆船加上十艘十炮单桅快船组成。

大员舰队，由保罗·杜拉弟纽司指挥，十艘五十炮武装商船以及十艘二十炮双桅快帆船，外加三十艘十炮单桅轻快帆船组成。

这个时候，刘钧惊讶于荷兰人舰队强大之时，也迅速的在调动自己的舰队。

他和郑芝龙商议过后，把舰队分成了四支分舰队。

由刘钧亲自统领的北洋舰队，这支舰队以84炮的四桅双层炮甲板的伏波号为旗舰，另有五十炮的四桅武装商船四艘，八炮三桅炮舰两艘，除了这七艘主力战舰外，北洋舰队还有双炮大青头鸟船十艘，双炮赶缯船十艘，快艇小船三十艘。

郑芝龙和郑芝豹各自指挥东海舰队和南海舰队，这两支舰队都各有五艘三桅炮舰，并各有青头、赶缯十艘，另还有发贡炮舰数艘，福船、沙船、快艇等若干。

长江舰队的主力战舰最少，这支由熊文灿指挥的舰队实际上是一支补给舰队，也是一支预备队。

除了这四支舰队外，在澎湖岛上还有岸炮部队，以及马步士兵。

一场庞大的海战即将开始，郑芝龙再次如同在料罗湾海战前一样，向舰队颁下了重重的赏格。

参战者每人给银二两，若战事延长，额外增给五两。每只火船16人，若烧了荷兰船，给六人银二百两，一个荷兰人头给银五十两。

做为此次海战的总指挥，刘钧同样不吝赏赐。

他向四支舰队以及岸上人马宣布，杀一个红夷士兵晋一级。战舰击沉敌主力舰一艘，官兵俱升一级，并赏银五十两。

崇祯十二年十一月九日，刘钧率舰队出港。

熊文灿劝刘钧不要出港，就停在港口之中。但刘钧和郑芝龙都决定出港迎战，虽然英荷联合舰队的实力更强，但也正因为他们战舰强大，拥有两千多门大炮，如果留在港口里，那么最大的结果就是他们被人堵住，然后直接被击沉在港口。